前列腺肥大应与前列腺癌、前列腺结核、前列腺结石、前列腺囊肿、膀胱颈挛缩（marion氏病）、输尿管间嵴肥大、神经病原性膀胱、膀胱肿瘤、结石、异物等相鉴别。上述诸病，通过查体、化验、肛指检查、膀胱镜检查，绝大多数情况均可作出鉴别。只有前列腺癌在非典型病例，依据前述检查方法，难以得出结论，可用以下方法，辅助鉴别诊断：
1.血清酸性磷酸酶测定：前列腺组织含酸性磷酸酶特高，有癌变时，含量增加，利用此原理进行此项检查，血清酸性磷酸酶正常值按king-armsstrong为1～5单位，按bodansky为0.5～2单位，自1950年新的检查方法确定其值0.7k-a单位。前列腺癌患者，半数以上高于正常值。注意于应用睾丸激素或作前列腺按摩后可出现假阳性。
2. 血清硷性磷酸酶测定：当有骨转移时，血清硷性磷酸酶为升高，正常值bodahsky2～4.5单位，king-armstrong8～14单位，但须注意假阳性。
3.前列腺活检：经会阴或直肠均可进行前列腺穿刺活检。
4.精囊射精管造影：前列腺肥大仅可见有对称性的扩大，边缘整齐；前列腺癌则见有狭窄、不规则、边缘不齐、或缺损。
