由于前列腺结石内常储存细菌，因此结石的间断排菌也是慢性前列腺炎反复发作和尿路感染反复发作的根源。另外，前列腺结石中的细菌还可躲藏在盐类和钙质的外壳内，不易被抗生素杀灭，因此结石又是慢性前列腺炎不易治愈和反复发作的原因之一。
前列腺单纯结石临床上可无症状，伴有慢性前列腺炎者可有尿频、血尿及会阴部疼痛。前列腺结石是在前列腺组织内形成，而不是在增生的前列腺组织内。故当并发前列腺增生时，增生组织将前列腺推向外侧并变薄，结石是在外科包膜内。
前列腺结石可引起慢性炎症，白细胞浸润，腺泡充满碎屑和脱落上皮，腺泡可扩张，腺腔的大小和形状可改变，腺泡间及结石周围的前列腺基质呈纤维化。
较大的结石可占据前列腺整个腺腔，仅剩下少量腺体组织。前列腺结石多发生在前列腺腺管远端部分，后叶及前列腺尿道周围区少见。故在增生的前列腺组织中，很少见到结石。
结石可粘附于腺瘤表面和变薄的腺组织上，故有时在前列腺增生经耻骨上切除的前列腺标本上可发现结石。结石可引起前列腺周围炎，严重时可形成脓肿。
