附睾炎的感染多由前列腺炎和精囊炎沿输精管蔓延到附睾，血运感染较少见。经尿道器械操作、频繁导尿、前列腺摘除术后留置尿管等均易引起附睾炎。引起附睾非特异性感染的致病菌以大肠杆菌、葡萄球菌、链球菌为多见。附睾感染后，常在尾部或头部遗留结节。
附睾炎急性时常与睾丸扭转相混淆，如果用手轻托阴囊疼痛缓解，说明是附睾炎，而睾丸扭转在上托阴囊后疼痛加剧。慢性附睾炎时输精管增粗，精索增厚，疼痛性质为隐痛，局部检查附睾呈硬块状，轻度压痛。
它与附睾结核的鉴别方法是：①附睾结核的输精管呈串珠样；②附睾结核与阴囊壁常有粘连，甚至形成窦道，而附睾炎则不具备这两个特点。
附睾炎的基本病机：早期附睾炎是一种蜂窝组织炎，始于射精管并蔓延至附睾的尾部。在急性期，附睾肿胀，质地较硬，感染由附睾的尾部向头部扩散。
在病理切片上，可以看到小脓肿，鞘膜常分泌一些浆液性液体（炎症性附睾水囊肿)。这些液体可包涵有脓液，精索变粗，睾丸继发性充血肿胀，但一般不发生炎症。
光镜下可见组织水肿，中性粒细胞、浆细胞及淋巴细胞浸润，随后可见脓肿形成，上皮可见坏死，炎症可完全吸收，但附睾小管周围纤维化常常导致管腔阻塞，如果是双侧附睾炎，可致不育。
